Fonction de la conformation tridimensionelle du génome dans la régulation des gènes

 

Josée Dostie

Université McGill

 

Domaine : cancer

Programme Chercheurs-boursiers - Senior

Concours 2019-2020

Le génome humain est composé de milliers de gènes codants pour tous les éléments nécessaires à la vie.  Dans la cellule, l'ADN génomique est divisé en longues molécules appelées "chromosomes".  Les chromosomes doivent être organisés et empaquetés de façon très précise afin d'être contenu à l'intérieur du volume cellulaire restreint.  Notre génome est organisé de façon fonctionnelle plutôt qu'aléatoire, ce qui permet à la machinerie transcriptionnelle d'avoir accès aux gènes.  Cette architecture génomique est nécessaire non seulement afin de réduire la longueur des chromosomes, mais aussi pour contrôler l'expression des gènes.  Il a été démontré qu'une mauvaise organisation chromosomique peut induire l'expression erronée de genes associées à certaines maladies et troubles dévelopementaux.  Il semble donc probable que l'architecture du génome peut être un marqueur diagnostique important de syndrômes humains.   Ces observations soulèvent deux questions importantes: "Comment est organisé le génome humain dans le noyau d'une cellule?", et "Quels sont les mécanismes impliqués dans la régulation de la conformation tridimensionelle du génome humain?". 

Mon programme de recherche utilise les techniques de type "3C" pour cartographier la conformation du génome de cellules cancéreuses ou saines durant la différentiation cellulaire.  Les techniques 3C sont des méthodes innovatrices relativement récentes et très sophistiquées qui permettent d'étudier l'architecture génomique à très haute résolution.  Selon notre hypothèse, les ARNs non-codants et certaines protéines associées à l'ADN génomique contribueraient à établir et maintenir la forme du génome afin de promouvoir ou d'empêcher l'expression des gènes.  Notre but est d'identifier des architectures génomiques contrôlées par ces ARNs et protéines, ainsi que de charactériser les méchanismes régulatoires impliqués durant le dévelopment et dans le cancer.